Trong lịch sử phong kiến Việt Nam, mỗi vị tướng lĩnh hay vua chúa, vương hầu khi chỉ huy một quân đội riêng luôn có một loại kỳ riêng biệt để phân biệt với các vua chúa, vương hầu hay tướng lĩnh khác, và cũng để phân biệt đạo quân này với đạo quân khác. Đặc biệt trong giai đoạn nhà Lê Trung Hưng, khi Đại Việt có nhiều biến cố, với sự nổi lên của rất nhiều tướng lĩnh sở hữu riêng cho mình những đạo quân riêng biệt.

Nguyên bản Long Tinh Kỳ ban đầu vốn là một lá cờ của chúa Nguyễn Hoàng. Cờ có hình dạng chữ nhật, viền ngoài hình vảy rồng, màu xanh, nền giữa màu vàng, trung tâm có một hình tròn màu đỏ.

Long Tinh Kỳ là tên gọi chính thức được sử dụng dưới thời Hoàng đế Gia Long để chỉ lá cờ của Quốc gia (1802 - 1945). Trong suốt quá trình tồn tại của mình, Long Tinh Kỳ đã bị thay đổi rất nhiều về thiết kế của mình